1952年底，王辉球从大西南调到了空军，当了空军政治部主任，一干就是16年，成了空军历史上首任真正的政治部主任。到了60年代，他还兼任了空军副政委。1965年，刘亚楼因病去世，吴法宪被提拔为空军司令员，政委的位置就空出来了。吴法宪推荐余立金当政委，可到了1968年，余立金遭遇冲击被迫靠边站，空军政委又没人干了。这时候，副政委里符合条件的就只剩王辉球一个人，所以他就被推上去接任了。吴法宪和王辉球的职务看着是平级的，实际上吴法宪的位置更高。1967年的时候，吴法宪成了军委办事组副组长，后来还兼任了总参第一副总长。军委办事组管军委的日常工作，副组长就相当于军委的副秘书长。虽然两人职位不一样，但他们关系特别铁。 1973年以后，王辉球基本上就淡出公众视线了，过了两年没事干的日子。到了1975年3月，这哥们终于被安排去沈阳军区当政委了。中间其实有点小插曲：有人觉得他在“九一三事件”里表现不好，建议把他降成副政委。结果报告报到最高领导那里，领袖亲自把“副”字给划掉了，决定让他继续干正职。其实在去东北之前，王辉球身体不太好，老伴也建议他别去那么冷的地方，调去济南军区养养身子。可他还是坚持去了沈阳，把在北京的战友和老领导都给告别了。 1975年之前，他已经赋闲两年了，这才又给安排了个大军区副职的位置。领导把“副”字给抹了，就让他转正职了。他可是红一方面军的老底子，以前一直在红一军团红二师搞宣传。抗战那会儿他进了115师下属的部队打了不少仗；解放战争时期他被调到刘邓领导的晋冀鲁豫军区当七纵政治部主任、一纵政治部主任和16军政委。跟着刘邓首长一路南征北战突破长江最后解放了大西南。 虽然吴法宪当的是空军司令员是一把手，可王辉球那个时候是政委也是二把手。毕竟他们俩搭档工作配合得特别好嘛。只不过九一三事件一出事儿之后压力特别大，不少人觉得他干不了这活儿要求把他免了。好在上面有人保着他没被撤职。 一直到1975年3月王辉球才重新露面被派去沈阳当政委。本来那个报告上说要让他降职当副政委的呢？结果毛主席亲自改了报告里的字儿决定让他继续当正职给他一次机会。