（问题）单细胞研究正从“看见细胞差异”走向“解释细胞命运”。但实际科研中，转录组、免疫组库与表观遗传信息往往来自不同实验路径：研究者需要分别完成RNA测序、TCR/BCR分析和甲基化检测，再在计算层面进行关联推断。由于样本来源、细胞状态、实验批次与数据尺度不一致，“同一细胞在不同层面信息难以精准对齐”成为常见难题。这不仅增加样本消耗和经费压力，也降低了回答“表观遗传如何驱动基因表达变化”等关键问题的效率与可信度。 （原因）业内人士认为——多组学整合长期受限——主要在于技术链条分散、流程复杂：一上，甲基化检测对文库构建和测序深度要求较高，传统方案多偏低通量，难以数量级上匹配大规模单细胞转录组数据；另一上，免疫组库与转录组常用于刻画免疫细胞谱系与功能状态，但若无法同步获得同一细胞的表观遗传状态，就很难建立稳健的调控与因果线索。随着肿瘤微环境、免疫应答、人类细胞图谱等研究对“全局覆盖+机制解释”的需求升高，分段式策略的短板愈发明显。 （影响），寻因生物伦敦举办的Festival of Genomics & Biodata大会上发布SeekOne® DD单细胞DNA甲基化+RNA一胞多组学解决方案。该方案基于其高通量基因捕获等技术路径，主打在同一细胞或细胞核内同步获取多维分子信息：包括RNA表达谱、免疫组库（TCR/BCR，适用于免疫细胞）以及全基因组DNA甲基化信号（覆盖5mC/5hmC层面）。通过“同源采集、同细胞配对”，方案试图从源头减少多组学数据割裂带来的偏差，使研究者在单细胞尺度上同时看到“表达结果”和“调控状态”，为解析细胞状态转换、分化路径与疾病进展提供更完整的证据链。 发布信息显示，该方案在通量与样本适配性上也有所提升：单个样本最高可处理约1.2万细胞，并兼容新鲜或冻存组织、单细胞或单细胞核输入。通量提升意味着在肿瘤异质性、免疫细胞亚群、组织发育梯度等研究中，既能获得更充分的统计覆盖，也更利于捕捉稀有细胞群体，从而提高对复杂系统的刻画精度。 在成本与效率层面，企业上表示可通过降低达到同等数据性能所需的测序量来控制测序开支，并借助自动化微流控流程缩短高通量分离与标记时间，减少操作难度与批次波动。业内观点认为，若这些指标多中心场景中得到验证，有望推动单细胞表观遗传与转录组联合测序从“少数实验室可开展的高门槛能力”走向“更易复制的研究基础设施”。 （对策）面向多组学一体化的产业与科研生态，专家建议从三上联合推进：其一，在关键应用领域建立标准化评测体系，围绕细胞配对准确率、甲基化覆盖与转录组捕获效率、批次一致性等指标开展公开透明的对比验证；其二，推动数据分析流程与数据库建设同步升级，形成可复用的质控标准、注释框架与跨平台整合方案，避免出现“实验一体化、分析仍割裂”；其三，在医学研究与药物研发中加强与临床样本规范、伦理合规及多中心队列的衔接，让技术优势转化为可解释、可验证、可落地的生物学发现与转化线索。 （前景）从应用前景看，这类方案有望在多个方向释放价值：在人类细胞图谱研究中，同步表观遗传与转录组数据可提高细胞类型与状态划分的分辨率，帮助建立更可靠的参考图谱；在衰老与发育生物学中，可用于追踪甲基化与表达程序的动态耦合，揭示组织成熟、衰老有关变化及发育异常的潜在机制；在肿瘤研究中，同细胞层面的甲基化与免疫转录组信息有助于理解肿瘤克隆演化、免疫浸润与免疫逃逸之间的关系，并为生物标志物筛选和机制验证提供更具指向性的证据。随着高通量、多维度测量成为趋势，单细胞研究或将从“描述性图谱”更走向“机制性建模”，提升疾病研究与药物靶点发现的效率。
生命科学的关键突破，往往来自对复杂系统实现“同源、同步、同尺度”测量能力的提升。单细胞多组学工具的迭代，让研究者拥有更接近真实生物过程的观测窗口。未来，能否在标准化流程、质量控制体系与跨中心数据可比性上形成共识，将决定有关技术从“可用”走向“好用、常用”的速度，也将影响其在重大疾病机制研究与精准医学探索中的实际价值。